苏州医药科技学校的前身为苏州市医药职工中等专业学校，是经江苏省人民政府批准，报国家教育部备案的中等专业学校，同时也是苏州市医药化工技工学校，属江苏省苏州食品药品监督管理局领导。

学校于1983年批准成立，并于当年秋季在医药系统职工中招收第一届学生40名，87年秋季起开始参与苏州市应届初中毕业生的高中段分流工作，招收应届初中毕业生至今。目前在校全日制学生均为应往届初中毕业生。目前学校除校长室外，设综合办公室、教务科、学生科、招生实训科、财务科五个职能部门，开设药学、食品科学、化工、环境科学、药品营销与管理、中药鉴定与调剂等多个专业。二十多年来,校领导带领全体教职工不懈努力，几经搬迁，从小到大，没用国家一分钱，终于在苏州国际教育园北区建设成为现今一个占地100余亩，建筑面积5.5万多平方米,各级各类在校师生4000余人,拥有数十个能满足不同教学要求的各类教室、实验室、多媒体教室、电教室、培训中心大楼等一流教学设施以及能容纳3000学生住宿的学生公寓的，集教学与培训于一体的，现代化的中等职业技术学校。
学校多次被评为江苏省医药系统职工教育先进集体和苏州市职工教育先进单位，尤其近年来，学校连续两年被苏州市政府评为“创建精神文明先进”单位，2005年又分别获得省级重点职业技术学校和苏州药监系统“先进党支部”的荣誉称号。有多人被评为江苏省优秀教育工作者，数人被推举为学科带头人，还有多名教师评为苏州市优秀教育工作者。学校还被推荐为全国医药职工教育协会副理事长单位。
学校办学二十多年来始终坚持为本地经济建设和社会发展服务的办学理念，坚持培养适应生产、经营、管理等服务于第一线需要的技术型、实用型专业技术人才的培养目标，坚持德育为先。全面发展，把学生行为养成教育和职业能力培养教育贯穿于教育全过程的教育模式，坚持探索、创新、开拓、进取，形成了一个以学历教育为主体，各种培训同时并举的多功能、多层次、多形式、多渠道、全方位的办学模式。
二十多年来我校毕业生遍布全省各地区，为江苏省医药产业及相关行业培养了大量的技术型、实用型人才，毕业生就业率达100%，就业质量高。学校已成为江苏省培养初、中级医药、化工、食品等专业人才的重要基地，深受企业和学生家长的好评，并在社会上享有一定的知名度，多次受到省、市有关部门的表彰。学校将以“建好一所学校，管好一所学校”为目标，做大、做强、做优。